Direktorat Kepengasuhan adalah lembaga yang membantu rektor dan wakil rektor I dalam membina mahasiswa santri di luar jam perkuliahan. Lembaga ini bisa disebut juga dengan lembaga kepengasuhan UNIDA Gontor.   

Dewan Mahasiswa (DEMA) adalah organisasi tertinggi mahasiswa, dari, oleh dan untuk mahasiswa yang menaungi seluruh aspek kehidupan mereka dan bertanggung jawab atas keseluruhan dinamika yang ada. 

Angka Kredit Penunjang Akademik Mahasiswa (AKPAM) merupakan salah satu media pendidikan yang dilakukan oleh Universitas Darussalam Gontor sebagai perguruan tinggi yang bersistem pesantren.

Sistem Asrama di Universitas Darussalam Gontor adalah sebuah sistem perguruan tinggi pesantren sebagai penunjang sistem kepengasuhan dalam pengawalan mahasiswa di asrama, yang mana hampir semua unsur masyarakatnya tinggal di dalam kampus itu sendiri.